個(gè)性化生物信息分析
1.全數(shù)據(jù)庫(kù)功能富集分析
通過(guò)基因組、表觀組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組等高通量組學(xué)檢測(cè)可能能夠獲得成百上千的候選差異分子，龐大的數(shù)據(jù)信息給科研工作者進(jìn)行下游有針對(duì)性的分子探索造成極大困難?；诠δ軘?shù)據(jù)庫(kù)富集分析，能夠提供所有信號(hào)通路、代謝途徑、生物學(xué)事件和功能類(lèi)別等的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性檢驗(yàn)結(jié)果，這些結(jié)果直接指引研究人員開(kāi)展下游驗(yàn)證工作的先后順序。
本公司通過(guò)整合Gene Ontology (GO)、KEGG、Reactome、DisGeNET等多種生物功能數(shù)據(jù)庫(kù)，推出“功能數(shù)據(jù)庫(kù)富集分析”服務(wù)項(xiàng)目，項(xiàng)目報(bào)告能反饋直接的下游分子探索方向和可用于文章發(fā)表的圖表，只需要您提供感興趣的基因列表或基因在不同樣品的表達(dá)矩陣。此外，也可提供定制化的富集分析服務(wù)。
圖：功能數(shù)據(jù)庫(kù)富集分析示例
2.轉(zhuǎn)錄因子/激酶/蛋白互作調(diào)控分子預(yù)測(cè)
轉(zhuǎn)錄因子和激酶對(duì)于基因、蛋白功能的調(diào)控至關(guān)重要。其中轉(zhuǎn)錄因子充當(dāng)著調(diào)節(jié)因子，其與廣泛的靶基因結(jié)合，控制著細(xì)胞類(lèi)型的決定、發(fā)育模式和疾病進(jìn)展，通過(guò)基于轉(zhuǎn)錄組差異基因和ChIP-SEQ數(shù)據(jù)庫(kù)的相互驗(yàn)證分析，能夠?qū)ι嫌无D(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制進(jìn)行深入探索；同樣地，激酶在細(xì)胞信號(hào)通路及其它重要的細(xì)胞過(guò)程中起關(guān)鍵性調(diào)節(jié)作用，因此其與疾病、發(fā)育等密切相關(guān)，基于磷酸化蛋白組學(xué)的磷酸化位點(diǎn)信息和預(yù)測(cè)算法，能夠預(yù)測(cè)催化磷酸肽的上游磷酸激酶。通過(guò)蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析能夠進(jìn)一步地鎖定上下游蛋白（基因）的潛在調(diào)控關(guān)系，有助于從精確鎖定該可行性的疾病機(jī)制調(diào)控、藥物新靶點(diǎn)等。本公司可提供定制化的上游調(diào)控分析服務(wù)。
圖：轉(zhuǎn)錄因子/激酶/蛋白互作預(yù)測(cè)示例
3.WGCNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和Hub靶點(diǎn)篩選
加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（WGCNA）是基于基因間表達(dá)數(shù)據(jù)的相似性來(lái)構(gòu)建基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，不僅可以挖掘高度相關(guān)的基因模塊，更可以直觀深入地反映基因之間潛在的表達(dá)調(diào)控關(guān)系以及處于其中核心位置的節(jié)點(diǎn)，即Hub基因。通過(guò)WGCNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析有助于后續(xù)驗(yàn)證性實(shí)驗(yàn)的迅速開(kāi)展，并為后續(xù)基因功能的研究提供重要的線索和分析基礎(chǔ)。本公司通過(guò)整合WGCNA及相關(guān)迭代算法開(kāi)展項(xiàng)目，您只需要提供基因在不同樣品的表達(dá)矩陣（轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、代謝組均可）和表型數(shù)據(jù)（可選），項(xiàng)目報(bào)告包含Hub基因功能打分等信息和可用于文章發(fā)表的高水平圖表。此外本公司也可提供定制化的分析和繪圖服務(wù)。
4.癌癥數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘與候選基因篩選?
TCGA、ICGC、GEO等癌癥相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)中收集了常見(jiàn)腫瘤的相關(guān)組學(xué)數(shù)據(jù)，包括轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、表觀遺傳組學(xué)等。同時(shí)，這些數(shù)據(jù)庫(kù)中包含樣本對(duì)應(yīng)的臨床數(shù)據(jù)，包括隨訪時(shí)間、腫瘤分期、病理類(lèi)型等重要信息，通過(guò)挖掘組學(xué)數(shù)據(jù)和與其關(guān)聯(lián)的臨床數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)腫瘤發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移等根本機(jī)制和核心調(diào)控分子。您只需要指定感興趣的癌癥類(lèi)型、數(shù)據(jù)庫(kù)以及研究目的，我們挖掘并提供可用于實(shí)驗(yàn)探索、開(kāi)展課題或基金撰寫(xiě)使用的素材，如果您有感興趣的基因，我們可通過(guò)數(shù)據(jù)挖掘的方式對(duì)其關(guān)鍵性進(jìn)行驗(yàn)證。此外本公司也提供定制化的腫瘤數(shù)據(jù)挖掘分析服務(wù)。
5.腫瘤亞型鑒定分析
有效的免疫治療必須建立在更好地了解腫瘤特異性免疫微環(huán)境之上，免疫微環(huán)境異質(zhì)性會(huì)導(dǎo)致免疫檢查點(diǎn)阻斷治療的不同反應(yīng)。基于基因型和基因表達(dá)模式上的差異，可以鑒定腫瘤亞型間的差異，挖掘與腫瘤臨床預(yù)后有關(guān)的免疫分子分類(lèi)器，從而為腫瘤患者的免疫治療提供新的途徑。我們推出的“腫瘤亞型鑒定分析”服務(wù)，其關(guān)注回答不同腫瘤亞型的分子特征這一重大科學(xué)問(wèn)題，該服務(wù)旨在尋找不同亞型根本特征，能夠直接指導(dǎo)后續(xù)的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證和科學(xué)研究工作。
6.生物信息繪圖服務(wù) (火山圖/熱圖/聚類(lèi)/韋恩圖/?；鶊D/網(wǎng)絡(luò)圖/Circos圖)
生物信息學(xué)分析后往往需要借助清晰直觀的圖片展示分析統(tǒng)計(jì)結(jié)果，是文章發(fā)表、基金申請(qǐng)、項(xiàng)目書(shū)撰寫(xiě)、學(xué)術(shù)會(huì)議匯報(bào)等的重要組成元素。我們推出的個(gè)性化繪圖服務(wù)只需客戶(hù)提交符合標(biāo)準(zhǔn)的結(jié)果文件，即可獲得精美的生物信息結(jié)果圖，提升科研成果品質(zhì)，為您的科研工作保駕護(hù)航。
